El biodièsel és un combustible que s’obté de recursos renovables com olis vegetals, greixos animals, o algues, que es tracten químicament per tal d’obtenir un combustible semblant al gasoil (dièsel) basat en el petroli. En l'actualitat existeixen diversos processos industrials amb els quals es pot obtenir biodièsel, però es posa en qüestió la seva efectivitat en un futur proper ja que obtenir biodièsel d'aquestes fonts oliveres, gira-sols, canyes de sucre, etc prdueix un encariment del preu dels aliments per això que ara s'investiga cap a un nou camp que pot ser el de les microalgues del fons marí. Els més importants són els següents:
1. Procés base-base, utilitzant com a catalitzador un hidròxid. Aquest hidròxid pot ser hidròxid de sodi (sosa càustica) o hidròxid de potassi (potassa càustica).
2. Procés acid-base. Aquest procés consisteix en fer primer una esterificació àcida i desprès seguir el procés normal (base-base), s'usa generalment per olis amb alt índex de acidés.
3. Processos supercrítics. En aquest procés ja no es necessari la presencia de catalitzador, simplement es fa a pressions elevades en las que el oli i l'alcohol reaccionen sense necesitat de què un agent extern com el hidròxid actuï en la reacció.
4. Processos enzimàtics. En la actualitat s'estan investigant alguns enzims que poden servir com acceleradors de la reacció oli-alcohol. Aquest procés no s'usa en la actualitat degut al seu alt cost, que impedeix que es pugui produir biodièsel en grans quantitats.
5. Mètode de reacció Ultrasònic En el mètode de reacció ultrasònica, les ones ultrasòniques causa'n que la barreja produeixi i col·lapsi bombolles constantment. Aquesta cavitassió proporciona simultàniament la barreja i la calor necessaris per portar el procés de transesterificació. Així, utilitzant un reactor ultrasònic per la producció del biodièsel, es redueix de manera dràstica el temps, temperatura i energia necessària per la reacció. El procés de transesterificació pot córrer en línia en lloc de utilitzar el lent mètode de processament per lots. Els dispositius ultrasònics de escala industrial permeten el processament de diversos milers de barrils per dia.